L’une des missions essentielles d’un musée est l’enrichissement de ses collections qui se traduit par une politique d’acquisitions visant à compléter et à renforcer certains fonds. Au MusBA, cette politique d’acquisitions est surtout axée depuis quelques années sur l’art bordelais du 18e au 20e siècle ainsi que sur le 19e siècle français, point fort des collections du musée.
Le musée s’enrichit chaque année d’œuvres (peintures, sculptures, arts graphiques) acquises soit à titre onéreux (achat en vente publique, en galerie ou auprès d’un particulier), soit à titre gracieux (dons dont ceux de la Société des Amis du musée des Beaux-Arts de Bordeaux, créée après-guerre, et legs). Conformément à la réglementation des musées labellisés « musées de France », chaque projet d’acquisition doit être soumis à une commission scientifique réunissant des experts de musées nationaux et régionaux.